La investigación en la UNIAGUSTINIANA es uno de los pilares fundamentales para el desarrollo académico, la transformación de las organizaciones y el aparato empresarial y gubernamental del país, a través de procesos de generación de nuevo conocimiento, transferencia, la consolidación de una cultura de la innovación, actividades de apropiación social, manifestaciones estéticas y el fomento de las vocaciones a partir de la formación de alto nivel en ciencia, tecnología e innovación del país. 

La investigación propende por la inserción de los actores que la promueven en diferentes contextos nacionales e internacionales de ciencia y tecnología a través de productos derivados de actividades de nuevo conocimiento, actividades de desarrollo tecnológico e innovación, actividades de apropiación social del conocimiento y formación de recursos humanos, que aborden y planteen problemas y preguntas en la frontera del conocimiento y que sean avalados por los entes y medios más idóneos para tales fines. En este sentido, las actividades de investigación de la UNIAGUSTINIANA estarán regidas por los valores que dan origen a la normatividad rectora que se reconoce en la institución orientada a la formación de personas con sentido humanista, pensamiento crítico y carácter innovador, comprometidas con la transformación del tejido social y la búsqueda incansable de la verdad.

La investigación se asume desde dos puntos de vista: el primero es el trabajo formal y sistemático conducente a crear y aplicar el conocimiento a partir de la transferencia para la solución de problemas científicos y el mejoramiento de las condiciones económicas, humanas, sociales y culturales de las personas en un contexto local, regional, nacional e internacional; y el segundo, a partir de la formación para la investigación como un proceso orientado a desarrollar capacidades para el planteamiento y solución de problemas de manera crítica, sistemática y argumentada